深圳港位于广东省珠江三角洲南部，拥有蛇口、赤湾、妈湾、东角头、盐田、福永机场、沙鱼涌、内河8个港区。
1、蛇口港
蛇口港是中国最大的转运中心之一，位于广东省深圳市蛇口半岛南端，是华南地区重要的集散中心和中转口岸。
2、赤湾港
赤湾港在深圳经济特区西部的南头半岛顶端，位于珠江口东岸，东经113°53'， 北纬22°28'附近，距香港在20海里。距珠海、澳门在50海里，水、陆路距广州约150公里。赤湾港三面环山，呈U型港湾，紧临水深航道，多式联运俱全，是一个内河船舶和远洋水深巨轮均能靠泊的河口良港。
3、深圳妈湾港区
该港区内主要经营散杂货、液体化工产品、油品和煤炭等。 妈湾港区面临珠江矾深水航道，以涨潮流为主，含沙量少，港区天然水深9～14米 。
4、东角头
东角头水运口岸,位置深圳市西部南头半岛,成立时间1985年3月,1987年1月，经国家批准为对外开放口岸。码头设计能力为50万吨。
5、深圳市盐田港集团有限公司原名“深圳东鹏实业有限公司”，成立于1985年2月26日，1994年11月15日开始使用现公司名“深圳市盐田港集团有限公司 ” ，是由深圳市政府授权经营的国有独资有限责任公司，深圳市国资委持公司100%股权。
6、深圳机场福永码头
其位于深圳宝安国际机场区西南角位置，距新航站楼仅2公里（车程约5分钟），陆路与宝安大道、广深沿江高速公路和机荷高速公路相接，水路距港澳约70分钟航程、距香港机场码头约40分钟航程。
主要经营：装卸搬运、货物仓储、联运服务，船舶外轮供应，五金、百货、针织品、建材的销售、集装箱上门维修、物业管理、房屋租赁、从事广告业务。
7、沙鱼涌是深圳市龙岗区葵涌街道办土洋社区下属的一个客家小渔村，位于沙鱼涌河出海口的南岸边上，出海口的南边是一个海滩，叫东芴海滩。沙鱼涌位于一条小河的入海口，沙滩长约200米，沙滩岸边常停泊有小渔船。
8、内河码头
内河码头是深圳特区地方建材的主要装卸码头。码头海岸线长308米，共有11个泊位，最大靠泊能力为500吨。